Mặc dù không có yêu cầu theo luật định đối với một thỏa thuận điều hành trong hầu hết các khu vực pháp lý, các thành viên của nhiều thành viên công ty trách nhiệm hữu hạn hoạt động mà không ai có thể gặp phải vấn đề. Không giống như luật pháp nhà nước liên quan đến các công ty cổ phần có chứng khoán, vốn rất phát triển và cung cấp nhiều quy định quản trị và bảo vệ cho tập đoàn và các cổ đông, hầu hết các bang không áp dụng các quy định quản trị và bảo vệ chi tiết cho các thành viên của công ty trách nhiệm hữu hạn. Do đó, trong trường hợp không có các điều khoản theo luật định như vậy, các thành viên của công ty trách nhiệm hữu hạn phải thiết lập các điều khoản quản trị và bảo vệ theo thỏa thuận điều hành hoặc tài liệu quản lý tương tự.

• Việc tăng vốn tài chính cho một công ty trách nhiệm hữu hạn có thể khó khăn hơn vì các nhà đầu tư có thể thoải mái hơn khi đầu tư vào các hình thức công ty được hiểu rõ hơn với quan điểm về IPO cuối cùng.[28] Một giải pháp khả thi có thể là thành lập một công ty cổ phần mới và sáp nhập vào nó, giải thể công ty trách nhiệm hữu hạn và chuyển đổi thành một công ty cổ phần.
• Nhiều khu vực pháp lý, bao gồm cả Alabama, California, Kentucky, New York, Pennsylvania, Tennessee và Texas. Thu đánh thuế đặc quyền kinh doanh hoặc thuế giá trị vốn đối với các công ty trách nhiệm hữu hạn. Về bản chất, thuế đặc quyền kinh doanh hoặc nhượng quyền thương mại này là phí mà công ty trách nhiệm hữu hạn trả cho nhà nước vì lợi ích của trách nhiệm hữu hạn. Thuế đặc quyền kinh doanh có thể là một khoản tiền dựa trên doanh thu, số tiền dựa trên lợi nhuận hoặc số tiền dựa trên số lượng chủ sở hữu hoặc số vốn được sử dụng trong tiểu bang hoặc kết hợp các yếu tố đó hoặc đơn giản là một khoản phí cố định ở Delaware.
  • Có hiệu lực tại Texas năm 2007, thuế nhượng quyền thương mại được thay thế bằng Thuế Ký quỹ kinh doanh Texas. Điều này được trả dưới dạng: thuế phải nộp = doanh thu - một số chi phí có hệ số phân bổ. Tuy nhiên, ở hầu hết các tiểu bang, lệ phí này là danh nghĩa và chỉ một khoản phí nhỏ có thể so sánh với thuế đánh vào các công ty cổ phần.
  • Ở California, cả công ty trách nhiệm hữu hạn nước ngoài và trong nước, và các quỹ tín thác, cho dù lợi nhuận hay phi lợi nhuận, trừ khi thực thể được miễn thuế, ít nhất phải nộp thuế thu nhập tối thiểu 800 USD mỗi năm cho Hội đồng thuế nhượng quyền thương mại; và không có công ty trách nhiệm hữu hạn, công ty hoặc ủy thác nước ngoài nào có thể tiến hành kinh doanh ở California trừ khi được đăng ký hợp lệ với Bộ trưởng Ngoại giao California.
• Phí gia hạn cũng có thể cao hơn. Ví dụ ở Maryland, tính phí một công ty cổ phần hoặc phi cổ phần là $ 120 cho điều lệ ban đầu và $ 100 cho một công ty trách nhiệm hữu hạn. Lệ phí nộp báo cáo hàng năm vào năm sau là 300 đô la cho các công ty cổ phần có chứng khoán và các công ty trách nhiệm hữu hạn. Lệ phí bằng không đối với các công ty cổ phần phi chứng khoán. Ngoài ra, một số tiểu bang, như New York, áp đặt yêu cầu xuất bản khi thành lập công ty trách nhiệm hữu hạn, yêu cầu các thành viên của công ty trách nhiệm hữu hạn xuất bản một thông báo trên các tờ báo trong khu vực địa lý rằng công ty trách nhiệm hữu hạn sẽ được thành lập. Đối với các công ty trách nhiệm hữu hạn nằm ở các khu vực đô thị lớn (ví dụ: Thành phố New York), chi phí xuất bản có thể là đáng kể.
• Cấu trúc quản lý của một công ty trách nhiệm hữu hạn có thể không được nêu rõ. Không giống như các công ty cổ phần, họ không bắt buộc phải có một ban giám đốc hoặc cán sự. (Điều này cũng có thể được coi là một lợi thế ở một vài điểm.)
• Các khu vực pháp lý đánh thuế bên ngoài Hoa Kỳ có khả năng coi công ty trách nhiệm hữu hạn hoa kỳ là một công ty cổ phần, bất kể đối xử với mục đích thuế của Hoa Kỳ như thế nào, ví dụ như một công ty trách nhiệm hữu hạn Hoa Kỳ hoạt động bên ngoài Hoa Kỳ hoặc là cư dân của khu vực tài phán nước ngoài.[29] Điều này rất có thể là quốc gia (như Canada) không công nhận công ty trách nhiệm hữu hạn là một hình thức kinh doanh được ủy quyền tại quốc gia đó.
• Các bên uỷ quyền của công ty trách nhiệm hữu hạn sử dụng nhiều chức danh khác nhau, ví dụ, thành viên, quản lý, thành viên quản lý, giám đốc quản lý, giám đốc điều hành, chủ tịch và đối tác. Như vậy, có thể khó xác định ai thực sự có thẩm quyền ký kết hợp đồng thay mặt công ty trách nhiệm hữu hạn.